Małgorzata Szczepanek jest specjalistką chorób wewnętrznych i gastroenterologii. Ukończyła wydział lekarski Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie. W latach 1997-2017 pracowała w Oddziale Gastroenterologii Szpitala Uniwersyteckiego w Krakowie, a w latach 2004-2017 zatrudniona była również w Klinice Gastroenterologii Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego. Od 2017 r pracuje w Zakładzie Dydaktyki Medycznej Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego oraz jako redaktor działu gastroenterologia w wydawnictwie Medycyna Praktyczna, a chorymi opiekuje się w ramach prywatnej placówki medycznej.
Spośród chorób układu pokarmowego szczególnie interesują ją choroby wątroby.
Biegle porozumiewa się w języku angielskim i francuskim, w stopniu podstawowym – w hiszpańskim, włoskim i rosyjskim.